تأخذ الرياضة النسوية أهمية كبيرة لدى ادارة الاتحاد من خلال تشكيل الفرق الرياضية العسكرية النسوية، أو البطولات الخاصة بالسيدات، وفي عام 2015 أقدم الاتحاد العام للرياضة العسكرية على خطوة مميزة بتشكيل المنتخب النسوي للقفز المظلي ، وهي خطوة فريدة على المستوى العربي، بحيث لا يوجد سوى فريق قفز نسوي واحد في المملكة المغربية ، وخاض المنتخب اول قفزاته بجنوب افريقيا عام 2015.

كما أطلق الاتحاد بطولة ماجدات فلسطين لتنس الطاولة عام ٢٠١٨ كبداية لعدة بطولات تخص سيدات الاجهزة الامنية و العسكرية، كما يشهد سباق الجري السنوي الذي ينظمه الاتحاد مشاركة واسعة  من الفتيات و السيدات وصولا الى اختيار ابرز المتسابقات واللاعبات للمشاركات الخارجية و كان آخرها ماراثون ايطاليا ٢٠١٦.